1. LAS ALIANZAS, conformadas entre dos o más actores o instituciones públicas o privadas con el fin de promover y apoyar proyectos que benefician a comunidades y grupos vulnerables. Los aliados firman un "Memorando de Entendimiento" en el que se establecen los compromisos de las partes. Las alianzas se concretan para el desarrollo de proyectos específicos.

2. LOS PROYECTOS, que tienen objetivos concretos y buscan resultados específicos que solucionen problemas socio-económicos o ambientales de algún municipio o departamento del país. Los proyectos son administrados por Alter Vida y desarrollados por técnicos de la institución y de las municipalidades y gobernaciones, con participación de las organizaciones de la sociedad civil.

3. LAS COORDINACIONES de las áreas de trabajo, que tienen a su cargo el buen desempeño de los proyectos específicos y las relaciones entre sus aliados correspondientes. Existen dos Coordinaciones, una para los proyectos en los gobiernos locales (Componente Gobiernos locales) y otra para los proyectos de descentralización y anticorrupción (Componente Descentralización y Anticorrupción). Cada una de ellas coordina a los equipos técnicos que desarrollan los proyectos específicos.

4. UN CONSEJO CONSULTIVO, es la instancia deliberativa. de intercambio de ideas, recomendaciones, sugerencias y propuestas para mejorar el desempeño de los proyectos y potenciar los resultados del Programa. El CONSEJO orienta los cambios necesarios en la gestión de los proyectos y determina líneas estratégicas de acción. Sus miembros son seleccionados de acuerdo a su trayectoria y conocimiento de los proyectos y regiones en donde se trabaja.